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Anschrift:

Prof. Dr. Mario Stanke

Institut für Mathematik und Informatik

Walther-Rathenau-Straße 47

D-17487 Greifswald

Büro:

Mehringstraße 48

Tel:

03834 864642

E-mail:

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Research interests

A major interest of our group are probabilistic models for structured biological data and efficient algorithms for inference in these models. In particular we are developing, training and implementing conditional random fields for different concrete applications such as gene prediction, recombination detection and protein interface prediction. Research topics include
  • Gene Finding
  • Comparative Genomics
  • Transcript Quantification using RNA-Seq
  • Coalescence Theory for Recombining Sequences
  • Algorithms for Next Generation Sequencing and RNA-Seq
  • Predicting Protein-Protein-Interfaces
  • Proteogenomics
  • Genetic Variation and Splicing
  • Recombination in HIV

Siehe auch Professur für Bioinformatik


 



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